Die Kirchengemeinde St. Michaelis war eine Kirchengemeinde an der Waldenburger Straße 4 in der Kreisstadt Helmstedt im Landkreis Helmstedt in Niedersachsen in Deutschland. 2015 schloss sie sich mit weiteren Kirchengemeinden zur Kirchengemeinde Georg Calixt Helmstedt zusammen. Nachdem 2022 die St.-Michaelis-Kirche geschlossen wurde, wurde auch die Kirchengemeinde aufgelöst.